RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-208ENST00000549107 LINC01600Q96MT4 127 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 C22orf24Q9Y442 160 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 CHTF8P0CG12 524 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 ETDBQ3ZM63 59 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 RYR2Q92736 4967 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1B0GX51 115 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 DNAL4O96015 105 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00167Q96N53 147 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1W2PNN7 141 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 RTL8CO15255 209 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 COX7BP24311 80 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 TNP2Q05952 138 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00575Q6W349 94 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 TEN1Q86WV5 123 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRR-208ENST00000549107 PRYO14603 147 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 hADV29S1A0JD25 119 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 PANO1I0J062 215 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 SNCGO76070 127 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 SPRR1AP35321 89 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 LCE6AA0A183 80 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 K7ERU9 68 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRR-208ENST00000549107 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 B5MCH6 92 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 REG3GQ6UW15 175 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 EPM2AB3EWF7 344 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 Q6ZQY7 126 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 Q6ZRX8 168 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 DPH3Q96FX2 82 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 J3QR89 54 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP10-2P60368 255 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRR-208ENST00000549107 Q9BRP9 147 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRR-208ENST00000549107 H3BQ85 93 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRR-208ENST00000549107 DNAH5Q8TE73 4624 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 PKD1P98161 4303 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 PRLHP81277 87 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1B0GV72 72 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 ERC2-IT1O76042 136 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 H0Y9J4 135 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 BCE1O60756 84 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP10-1P60331 282 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-208ENST00000549107 UBE2AP49459 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 VPS25Q9BRG1 176 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 Q6ZSA8 131 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 Q8N377 158 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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