RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 C9orf92A6NGG3 77 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 SNAPINO95295 136 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 NPC2P61916 151 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 LIMD2Q9BT23 127 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 CFC1BP0CG36 223 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 PLNP26678 52 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 NMUP48645 174 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 HERVK_113P61574 105 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 C5orf52A6NGY3 159 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 LEPROTL1O95214 131 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 NDUFA5Q16718 116 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 SVBPQ8N300 66 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 YPEL4Q96NS1 127 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-214ENST00000548849 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 DPM2O94777 84 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 SPRR1BP22528 89 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 IGKCP01834 107 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 A0A0J9YXY3 114 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 FABP4P15090 132 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 SERF1AO75920 110 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 TRGC2P03986 189 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 LINC00310P59036 64 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-214ENST00000548849 M0R2T5 61 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 H7C2G1 150 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 TAL2Q16559 108 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 Q1RN00 199 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 SPANXCQ9NY87 97 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 CD164Q04900 197 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 PRO1933Q9H354 126 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 E9PLD3 99 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 COX7BP24311 80 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-214ENST00000548849 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 C6orf99Q4VX62 202 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 LITAFQ99732 161 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 AKR1D1P51857 326 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 C1orf195Q5TG92 126 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 TIMM17BO60830 172 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-214ENST00000548849 Q5XG85 94 aa9.05□□□□□ -0.96
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CS-214ENST00000548849 A0A0G2JQZ4 141 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-214ENST00000548849 ZNF815PA8K554 130 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-214ENST00000548849 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-214ENST00000548849 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-214ENST00000548849 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GWB2 263 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-214ENST00000548849 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 TCL1BO95988 128 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 A6NDN8 102 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 LINC01545Q5VT33 79 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 COLCA2A8K830 154 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 Q6Q795 121 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 PET117Q6UWS5 81 aa8.91□□□□□ -0.98
CS-214ENST00000548849 A4D1N5 150 aa8.9□□□□□ -0.98
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CS-214ENST00000548849 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 F8WEM9 126 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 PCP2Q8IVA1 136 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 IFITM1P13164 125 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BKO60814 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BJP06899 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 C3orf79P0CE67 100 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BOP23527 126 aa8.84□□□□□ -0.99
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CS-214ENST00000548849 HIST1H2BCP62807 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-214ENST00000548849 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.83□□□□□ -1
CS-214ENST00000548849 Q6ZVH6 145 aa8.83□□□□□ -1
CS-214ENST00000548849 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.83□□□□□ -1
CS-214ENST00000548849 KRTDAPP60985 99 aa8.81□□□□□ -1
CS-214ENST00000548849 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.81□□□□□ -1
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