RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00310P59036 64 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DAND5Q8N907 189 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.03□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.03□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.03□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 COLCA2A8K830 154 aa5.02□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 B5MCH6 92 aa5.02□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NDUFC2O95298 119 aa5.02□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.02□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q8NBF4 154 aa5.02□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPINK1P00995 79 aa5.01□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00483Q53H64 154 aa5.01□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q6ZRX8 168 aa5.01□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 E9PLD3 99 aa5□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A0J9YXY3 114 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGLV6-57P01721 117 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NPC2P61916 151 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MOBPQ13875 183 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q9BRP9 147 aa4.99□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ERC2-IT1O76042 136 aa4.98□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.97□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.97□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.97□□□□□ -1.61
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BKO60814 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TIMM17BO60830 172 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BJP06899 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BOP23527 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BBP33778 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BDP58876 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BCP62807 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PET117Q6UWS5 81 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPANXCQ9NY87 97 aa4.96□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C5orf52A6NGY3 159 aa4.95□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF815PA8K554 130 aa4.95□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC25A20O43772 301 aa4.95□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC01545Q5VT33 79 aa4.95□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.95□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.94□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.94□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q8N377 158 aa4.94□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.93□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.93□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LITAFQ99732 161 aa4.93□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.93□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.93□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C3orf79P0CE67 100 aa4.92□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTDAPP60985 99 aa4.92□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.92□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.92□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 COPS9Q8WXC6 57 aa4.92□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C20orf202A1L168 122 aa4.91□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.91□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.91□□□□□ -1.62
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPRR1BP22528 89 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 COX7BP24311 80 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C6orf99Q4VX62 202 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LIMD2Q9BT23 127 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MUC2Q02817 5179 aa4.9□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AKR1D1P51857 326 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TAL2Q16559 108 aa4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IFITM1P13164 125 aa4.88□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A6NDN8 102 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q6ZVH6 145 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A1B0GWB2 263 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q1RN00 199 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ATOH7Q8N100 152 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRO1933Q9H354 126 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms