RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRK-216ENST00000524481 UPK3BQ9BT76 320 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-216ENST00000524481 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-216ENST00000524481 M0QXV9 152 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRK-216ENST00000524481 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
PTPRK-216ENST00000524481 PRLHP81277 87 aa7.59□□□□□ -1.2
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PTPRK-216ENST00000524481 DSCR8Q96T75 97 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRK-216ENST00000524481 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-216ENST00000524481 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRK-216ENST00000524481 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PTPRK-216ENST00000524481 C3orf84H3BNL1 204 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-216ENST00000524481 ERC2-IT1O76042 136 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 PANO1I0J062 215 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 ACYP1P07311 99 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 REG3GQ6UW15 175 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRK-216ENST00000524481 C14orf177Q52M58 125 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 C16orf90A8MZG2 172 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00643Q86TS7 51 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRK-216ENST00000524481 Q9BRP9 147 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRK-216ENST00000524481 UBE2AP49459 152 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRK-216ENST00000524481 F8WDY8 70 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 UQCRQO14949 82 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZRX8 168 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-216ENST00000524481 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01600Q96MT4 127 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRK-216ENST00000524481 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRK-216ENST00000524481 RTL8CO15255 209 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRK-216ENST00000524481 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRK-216ENST00000524481 TNP2Q05952 138 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-216ENST00000524481 F8WEM9 126 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-216ENST00000524481 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-216ENST00000524481 IMUPQ9GZP8 106 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRK-216ENST00000524481 C1orf137Q5JT78 98 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRK-216ENST00000524481 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRK-216ENST00000524481 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 Q6JHZ5 121 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-216ENST00000524481 SPRR1AP35321 89 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-216ENST00000524481 PDE6GP18545 87 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-216ENST00000524481 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.32□□□□□ -1.24
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