RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZRU5 148 aa4.51□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.51□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 VPREB1P12018 145 aa4.51□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 COX7BP24311 80 aa4.51□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 LYRM9A8MSI8 78 aa4.51□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 CXCL6P80162 114 aa4.51□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZRP5 223 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 WIPF1O43516 503 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 NREPQ16612 68 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 LELP1Q5T871 98 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.5□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0G2JQZ4 141 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PNN7 141 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGKV4-1P06312 121 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 MIFP14174 115 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOTCH1P46531 2555 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.49□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 C15orf56Q8N910 161 aa4.48□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.48□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.48□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM168BA1KXE4 195 aa4.47□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.47□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q8N377 158 aa4.47□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 OCR1Q9BZK8 76 aa4.47□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.47□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 STAB1Q9NY15 2570 aa4.46□□□□□ -1.69
RAPGEF6-211ENST00000512611 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.46□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.46□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL6A5A8TX70 2615 aa4.46□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.46□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDE6GP18545 87 aa4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 M0R378 163 aa4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 ESRGQ1W209 222 aa4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 TENM2Q9NT68 2774 aa4.45□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCE1O60756 84 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZTC4 211 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMIM29Q86T20 159 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 CASC10Q5T4H9 136 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q9BRP9 147 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRO0628Q9UI54 55 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PNM2 257 aa4.44□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 APOC4P55056 127 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 C7orf33Q8WU49 177 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERC2-IT1O76042 136 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 F8WDY8 70 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.43□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 INAFM1C9JVW0 142 aa4.42□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.42□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRYO14603 147 aa4.42□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRR4Q16378 134 aa4.42□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.42□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7EQZ3 153 aa4.4□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.4□□□□□ -1.7
RAPGEF6-211ENST00000512611 DSCR10P59022 87 aa4.4□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.4□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.4□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.4□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFC1O43677 76 aa4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP10-11P60412 298 aa4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYCNQ0VAF6 134 aa4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 C1orf137Q5JT78 98 aa4.39□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BQ85 93 aa4.38□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZRX8 168 aa4.38□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 TNP2Q05952 138 aa4.37□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.37□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 A8MU10 97 aa4.37□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.37□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 hDV103S1A0JD37 113 aa4.35□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSPHP1O15172 72 aa4.35□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 PMAIP1Q13794 54 aa4.35□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q8NBF4 154 aa4.35□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.34□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.34□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2BP63146 152 aa4.34□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.34□□□□□ -1.71
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.34□□□□□ -1.72
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.1 ms