RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492932.5

PDCD4-210, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-210ENST00000492932 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 ERC2-IT1O76042 136 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 IGLV6-57P01721 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 NPC2P61916 151 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 Q9BRP9 147 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.54□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 Q8N377 158 aa6.54□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 A0A0J9YXY3 114 aa6.53□□□□□ -1.36
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PDCD4-210ENST00000492932 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-210ENST00000492932 C5orf52A6NGY3 159 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 E9PLD3 99 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 MUC17Q685J3 4493 aa6.52□□□□□ -1.37
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PDCD4-210ENST00000492932 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 LIMD2Q9BT23 127 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.5□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 A6NJY4 79 aa6.49□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.49□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.49□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 TIMM17BO60830 172 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 COLCA2A8K830 154 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-210ENST00000492932 ZNF815PA8K554 130 aa6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 COX7BP24311 80 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 TAL2Q16559 108 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 XP32Q5T750 250 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 PET117Q6UWS5 81 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 COPS9Q8WXC6 57 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 SPRR1BP22528 89 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 LINC01545Q5VT33 79 aa6.43□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.43□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 LITAFQ99732 161 aa6.43□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.42□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 C6orf99Q4VX62 202 aa6.42□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.42□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.42□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 PRO1933Q9H354 126 aa6.42□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 HIST1H2BKO60814 126 aa6.41□□□□□ -1.38
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PDCD4-210ENST00000492932 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.41□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.4□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 C20orf202A1L168 122 aa6.4□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 CD164Q04900 197 aa6.4□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 Q1RN00 199 aa6.4□□□□□ -1.38
PDCD4-210ENST00000492932 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.39□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.39□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 A6NDN8 102 aa6.39□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 H7C2G1 150 aa6.39□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 KRTDAPP60985 99 aa6.39□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.39□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 A0A1B0GWB2 263 aa6.38□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 C9orf92A6NGG3 77 aa6.38□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 AKR1D1P51857 326 aa6.38□□□□□ -1.39
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PDCD4-210ENST00000492932 C3orf79P0CE67 100 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 IFITM1P13164 125 aa6.37□□□□□ -1.39
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PDCD4-210ENST00000492932 A4D1N5 150 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 PCOTHQ58A44 107 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-210ENST00000492932 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 F8WEM9 126 aa6.32□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 TCL1BO95988 128 aa6.32□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 VAMP3Q15836 100 aa6.32□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 Q5XG85 94 aa6.32□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.32□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.31□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 ATOH7Q8N100 152 aa6.31□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.3□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 SMIM29Q86T20 159 aa6.3□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 CFC1BP0CG36 223 aa6.29□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 C1orf195Q5TG92 126 aa6.29□□□□□ -1.4
PDCD4-210ENST00000492932 PCP2Q8IVA1 136 aa6.28□□□□□ -1.4
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