RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 TEN1Q86WV5 123 aa2.56□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.56□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.56□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.56□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LCE6AA0A183 80 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 M0R378 163 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 SLC25A20O43772 301 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 TCL1BO95988 128 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 DNAL4O96015 105 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 IGLV6-57P01721 117 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 ACYP1P07311 99 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LINC01620Q4KN68 170 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 C2orf82Q6UX34 121 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 DAND5Q8N907 189 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 C15orf56Q8N910 161 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 PRO0461Q9UI25 63 aa2.55□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 A0A0U1RRA0 63 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 PSCAO43653 123 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.54□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 C16orf90A8MZG2 172 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 C9JAW5 83 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 H7C2G1 150 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 PDE6GP18545 87 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 NPC2P61916 151 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LCE3AQ5TA76 89 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 Q6ZRU5 148 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 LINC00167Q96N53 147 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.53□□□□□ -2
RARB-208ENST00000489694 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 A0A1B0GW54 56 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 WFDC2Q14508 124 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 ETDBQ3ZM63 59 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 Q6ZRP5 223 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C6orf223Q8N319 242 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 Q8N814 137 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 DIRC1Q969H9 104 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 Q9HAA7 133 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.52□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 hADV29S1A0JD25 119 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 LINC00575Q6W349 94 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 Q6ZR54 194 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.51□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 EPM2AB3EWF7 344 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 H0Y9J4 135 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 COX7BP24311 80 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 SPRR1AP35321 89 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C6orf99Q4VX62 202 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 CLEC2BQ92478 149 aa2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 LECT2O14960 151 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 LY6G6CO95867 125 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 SCGB1A1P11684 91 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 VPS25Q9BRG1 176 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 IMUPQ9GZP8 106 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.49□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 NCR3O14931 201 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 CDK2AP2O75956 126 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 Q6ZRX8 168 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 SIGMAR1Q99720 223 aa2.48□□□□□ -2.01
RARB-208ENST00000489694 C22orf24Q9Y442 160 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms