RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 Q8NDZ9 215 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.07□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.06□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 H3BMG7 143 aa4.06□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 TCL1BO95988 128 aa4.06□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.05□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 F8W1H4 67 aa4.05□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 LST1O00453 97 aa4.05□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 SNCGO76070 127 aa4.05□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 TRACP01848 142 aa4.05□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 LINC01620Q4KN68 170 aa4.05□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 A0A096LNI7 61 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 LCE6AA0A183 80 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 A0A1B0GX51 115 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 M0QXV9 152 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 CLEC2BQ92478 149 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 DIRC1Q969H9 104 aa4.04□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 C9JAW5 83 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 RTL8CO15255 209 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 C6orf99Q4VX62 202 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 C7orf33Q8WU49 177 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 PRO0461Q9UI25 63 aa4.03□□□□□ -1.76
MFSD1-217ENST00000489639 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 FAM168BA1KXE4 195 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 H3BT86 120 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 PRYO14603 147 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 DNAL4O96015 105 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 LINC01600Q96MT4 127 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 C22orf24Q9Y442 160 aa4.02□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 SLC25A20O43772 301 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 COX7BP24311 80 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00575Q6W349 94 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00167Q96N53 147 aa4.01□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 STARD9Q9P2P6 4700 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 A0A087WYN8 130 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 A0A1W2PNN7 141 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 H3BQ85 93 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 CHTF8P0CG12 524 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 MTURNQ8N3F0 131 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 SPACA4Q8TDM5 124 aa4□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 hADV29S1A0JD25 119 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 EPM2AB3EWF7 344 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 SPRR1AP35321 89 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 TEN1Q86WV5 123 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 DPH3Q96FX2 82 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.99□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.98□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 ETDBQ3ZM63 59 aa3.98□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.98□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 REG3GQ6UW15 175 aa3.98□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.98□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 B5MCH6 92 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 J3QR89 54 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 UBE2BP63146 152 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZRX8 168 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 MUC2Q02817 5179 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.97□□□□□ -1.77
MFSD1-217ENST00000489639 PANO1I0J062 215 aa3.96□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.96□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 K7ERU9 68 aa3.96□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 H0Y9J4 135 aa3.95□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZQY7 126 aa3.95□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.94□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 BCE1O60756 84 aa3.94□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.94□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.93□□□□□ -1.78
MFSD1-217ENST00000489639 Q6ZSA8 131 aa3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms