RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 OCR1Q9BZK8 76 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 Q8N377 158 aa7.17□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 A0A0U1RQV1 116 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.15□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 SYCNQ0VAF6 134 aa7.15□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 ESRGQ1W209 222 aa7.15□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 Q8N9L7 120 aa7.15□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 HIVEP2P31629 2446 aa7.15□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 C7orf33Q8WU49 177 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 FBN3Q75N90 2809 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 TNP2Q05952 138 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 Q6ZTC4 211 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 MRAPQ8TCY5 172 aa7.14□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 PRYO14603 147 aa7.13□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 VWFP04275 2813 aa7.13□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 TENM4Q6N022 2769 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 C3orf84H3BNL1 204 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 SPRR1AP35321 89 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 Q6ZRX8 168 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 INAFM1C9JVW0 142 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.11□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 LCE6AA0A183 80 aa7.11□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 A0A1W2PNM2 257 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 RETNQ9HD89 108 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 Q9BRP9 147 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 SPRR4Q96PI1 79 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 PRO0628Q9UI54 55 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 Q8NBF4 154 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-215ENST00000489048 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.08□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 C1orf137Q5JT78 98 aa7.07□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.07□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 ITPR2Q14571 2701 aa7.07□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 SMIM29Q86T20 159 aa7.07□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 HIVEP1P15822 2718 aa7.06□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.06□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.06□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 KRTAP10-11P60412 298 aa7.06□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.05□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.05□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.05□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.05□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.05□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.04□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 NOTCH2Q04721 2471 aa7.04□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.04□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 DSCR10P59022 87 aa7.04□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.04□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 FAM168BA1KXE4 195 aa7.03□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.03□□□□□ -1.28
NEB-215ENST00000489048 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.02□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.01□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 K7EQZ3 153 aa6.99□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 CASC10Q5T4H9 136 aa6.99□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 hDV103S1A0JD37 113 aa6.99□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.99□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.98□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 ANK2Q01484 3957 aa6.98□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 REG3GQ6UW15 175 aa6.98□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.97□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.97□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 UBE2BP63146 152 aa6.97□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.97□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 HCG22E2RYF7 251 aa6.97□□□□□ -1.29
NEB-215ENST00000489048 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.95□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.95□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 PSCAO43653 123 aa6.94□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 IGFL1Q6UW32 110 aa6.94□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.94□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 Q1T7F1 81 aa6.92□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.92□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 ATRQ13535 2644 aa6.92□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 BRK1Q8WUW1 75 aa6.92□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 NDUFB1O75438 58 aa6.9□□□□□ -1.3
NEB-215ENST00000489048 C16orf90A8MZG2 172 aa6.89□□□□□ -1.31
NEB-215ENST00000489048 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NEB-215ENST00000489048 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.88□□□□□ -1.31
NEB-215ENST00000489048 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NEB-215ENST00000489048 TENM3Q9P273 2699 aa6.88□□□□□ -1.31
NEB-215ENST00000489048 A0A087WSZ3 146 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms