RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485612.5

SSR4-210, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-210ENST00000485612 LEPROTO15243 131 aa6.65□□□□□ -1.34
SSR4-210ENST00000485612 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.65□□□□□ -1.34
SSR4-210ENST00000485612 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.65□□□□□ -1.34
SSR4-210ENST00000485612 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 HSBP1O75506 76 aa6.64□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 S100A12P80511 92 aa6.64□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 PCOTHQ58A44 107 aa6.64□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.64□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 IGLV6-57P01721 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 LINC00310P59036 64 aa6.63□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 NPC2P61916 151 aa6.63□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.62□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 J3QQQ9 107 aa6.62□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.62□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.61□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 NDUFC2O95298 119 aa6.6□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.6□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 C9orf92A6NGG3 77 aa6.59□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 SERF1AO75920 110 aa6.59□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 LEPROTL1O95214 131 aa6.59□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.59□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SSR4-210ENST00000485612 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 DPM2O94777 84 aa6.58□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 PLNP26678 52 aa6.58□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.58□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 A0A0J9YXY3 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 TRGC2P03986 189 aa6.57□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 FABP4P15090 132 aa6.57□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 NMUP48645 174 aa6.57□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 IGKCP01834 107 aa6.56□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 HERVK_113P61574 105 aa6.56□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 SPRR1BP22528 89 aa6.54□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 LITAFQ99732 161 aa6.53□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 LIMD2Q9BT23 127 aa6.53□□□□□ -1.36
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.52□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.52□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.52□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 C5orf52A6NGY3 159 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 E9PLD3 99 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 CFC1P0CG37 223 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 H7C2G1 150 aa6.5□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 Q1RN00 199 aa6.5□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 SPANXCQ9NY87 97 aa6.5□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 COLCA2A8K830 154 aa6.49□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.49□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.49□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 A0A0G2JQZ4 141 aa6.48□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.48□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 COX7BP24311 80 aa6.47□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 C6orf99Q4VX62 202 aa6.47□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.47□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.47□□□□□ -1.37
SSR4-210ENST00000485612 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.46□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.46□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 TIMM17BO60830 172 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 CD164Q04900 197 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 TAL2Q16559 108 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 C1orf195Q5TG92 126 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 SMIM29Q86T20 159 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 PRO1933Q9H354 126 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 ZNF815PA8K554 130 aa6.44□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.44□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.43□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.42□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 LINC01545Q5VT33 79 aa6.42□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 Q5XG85 94 aa6.41□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 AKR1D1P51857 326 aa6.4□□□□□ -1.38
SSR4-210ENST00000485612 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.39□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.39□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BKO60814 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BJP06899 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BOP23527 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BBP33778 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BDP58876 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BCP62807 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 Q6Q795 121 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 A0A1B0GWB2 263 aa6.37□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 LCE2BO14633 110 aa6.36□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 C3orf79P0CE67 100 aa6.36□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 PET117Q6UWS5 81 aa6.36□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 A6NDN8 102 aa6.35□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.35□□□□□ -1.39
SSR4-210ENST00000485612 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.2 ms