RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.19□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZRP5 223 aa11.19□□□□□ -0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZQT0 140 aa11.18□□□□□ -0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRYLO94915 3013 aa11.18□□□□□ -0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-11P60412 298 aa11.03□□□□□ -0.64
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.81□□□□□ -0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00313P59037 77 aa10.8□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM104AQ969W3 186 aa10.8□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MWP4 228 aa10.79□□□□□ -0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.75□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITPR2Q14571 2701 aa10.75□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.75□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.72□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PNM2 257 aa10.72□□□□□ -0.69
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