RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZRX8 168 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 Q9BRP9 147 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8N377 158 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0J9YXY3 114 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFC2O95298 119 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV6-57P01721 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00310P59036 64 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 TAL2Q16559 108 aa4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 E9PLD3 99 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf92A6NGG3 77 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 COLCA2A8K830 154 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 LIMD2Q9BT23 127 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SPANXCQ9NY87 97 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF815PA8K554 130 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 COX7BP24311 80 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 Q1RN00 199 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 XP32Q5T750 250 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf52A6NGY3 159 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 H7C2G1 150 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 C6orf99Q4VX62 202 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 A6NDN8 102 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 TIMM17BO60830 172 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTDAPP60985 99 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 PCOTHQ58A44 107 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 PET117Q6UWS5 81 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 LITAFQ99732 161 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 PRO1933Q9H354 126 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BKO60814 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BJP06899 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 SPRR1BP22528 89 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BOP23527 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BBP33778 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BDP58876 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BCP62807 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01545Q5VT33 79 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 AKR1D1P51857 326 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 C3orf79P0CE67 100 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 COPS9Q8WXC6 57 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0G2JQZ4 141 aa4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 ATOH7Q8N100 152 aa4.67□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GWB2 263 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 C20orf202A1L168 122 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 CD164Q04900 197 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 IFITM1P13164 125 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 F8WEM9 126 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM29Q86T20 159 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 A4D1N5 150 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R2T5 61 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 TCL1BO95988 128 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 VAMP3Q15836 100 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf195Q5TG92 126 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 PCP2Q8IVA1 136 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE2CQ5TA81 110 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZVH6 145 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 MT1HP80294 61 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 CFC1BP0CG36 223 aa4.59□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 Q5XG85 94 aa4.59□□□□□ -1.67
SH3BP1-204ENST00000459646 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.58□□□□□ -1.68
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms