RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX7B2Q8TF08 81 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PNN7 141 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CKS1BP61024 79 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8IZM0 81 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BRM9 83 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BPY2O14599 106 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8VRH5 84 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM223A0PJW6 202 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRO0628Q9UI54 55 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPM2O94777 84 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTDAPP60985 99 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNXBP22105 4242 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HERC1Q15751 4861 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKCP01834 107 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C3orf79P0CE67 100 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLNP26678 52 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERG28Q9UKR5 140 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM13P0DJ93 91 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATOH7Q8N100 152 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8NDZ9 215 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LEPROTO15243 131 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00158P58513 81 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2BP63146 152 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01545Q5VT33 79 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C22orf24Q9Y442 160 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 J3QQQ9 107 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100A6P06703 90 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf137Q5JT78 98 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAND5Q8N907 189 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100A2P29034 98 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPC2P61916 151 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00167Q96N53 147 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV2D-28P01615 120 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf202A1L168 122 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCR3O14931 201 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX17Q14061 63 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFTA2Q6UW10 78 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV7-43P04211 117 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF815PA8K554 130 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM238C9JI98 176 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q5W150 140 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A8MU10 97 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCE1O60756 84 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRLHP81277 87 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00587B1AMM8 73 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0R378 163 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1HL1P0DM35 61 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-12P60413 245 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM126AQ9H061 195 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DIRC1Q969H9 104 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LUZP6Q538Z0 58 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.9□□□□□ -1.63
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