RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 NCR3O14931 201 aa6.62□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 S100A12P80511 92 aa6.62□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.62□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.62□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 PRYO14603 147 aa6.61□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.61□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 SPATA45Q537H7 98 aa6.61□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.61□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM223A0PJW6 202 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM13P0DJ93 91 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 NMUP48645 174 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 HERVK_113P61574 105 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 PRO1933Q9H354 126 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-210ENST00000453030 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.58□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.58□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 SPRR1AP35321 89 aa6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 MOBPQ13875 183 aa6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 C14orf144Q96I85 54 aa6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 E9PLD3 99 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 LEPROTO15243 131 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 SPINK1P00995 79 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00483Q53H64 154 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 PCP2Q8IVA1 136 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 J3QQQ9 107 aa6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 ERC2-IT1O76042 136 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 COX8AP10176 69 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 HERV-K104P63124 156 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 Q8N377 158 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF815PA8K554 130 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 B5MCH6 92 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 TSTD3H0UI37 97 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 DDTP30046 118 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 Q9BRP9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00587B1AMM8 73 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZRX8 168 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 SLC25A20O43772 301 aa6.48□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.48□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.48□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0J9YXY3 114 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 DLEU1O43261 78 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 XP32Q5T750 250 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 NPC2P61916 151 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV6-57P01721 117 aa6.43□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.43□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H4GQ99525 98 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 HIGD1BQ9P298 99 aa6.42□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFC2O95298 119 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 LITAFQ99732 161 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-210ENST00000453030 C9orf92A6NGG3 77 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 TIMM17BO60830 172 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 HSD52Q0P140 79 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 BATFQ16520 125 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 PCOTHQ58A44 107 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 LIMD2Q9BT23 127 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 SPANXCQ9NY87 97 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 CEND1Q8N111 149 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.37□□□□□ -1.39
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