RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444502.5

TOP3B-210, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 4,163 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-210ENST00000444502 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 Q6ZQY7 126 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 Q6ZRU5 148 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 LINC01600Q96MT4 127 aa7.21□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 NREPQ16612 68 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 B9D2Q9BPU9 175 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 NDUFC1O43677 76 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 C10orf25Q5T742 122 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 ZFHX3Q15911 3703 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 Q8N9L7 120 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 M0R378 163 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 COX17Q14061 63 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 C7orf33Q8WU49 177 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 NDUFS5O43920 106 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 BPY2O14599 106 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 Q6ZVQ6 151 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 Q8N814 137 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 MUC7Q8TAX7 377 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 PRYO14603 147 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3B-210ENST00000444502 C3orf84H3BNL1 204 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 C22orf24Q9Y442 160 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 KLKP1Q107X0 134 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 H0Y9J4 135 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 H3BNG1 76 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 PRLHP81277 87 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 KIAA0087Q14695 138 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00575Q6W349 94 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 NDUFB1O75438 58 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 CHTF8P0CG12 524 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 CD164Q04900 197 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 C1orf137Q5JT78 98 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 A6NED7 52 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 REG3GQ6UW15 175 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 A8MUN3 132 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 PDE6GP18545 87 aa7.05□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 H3BQ85 93 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 PRR15LQ9BU68 103 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 Q6ZQT0 140 aa7.03□□□□□ -1.28
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00167Q96N53 147 aa7.02□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 PRR34Q9NV39 138 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.01□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 VPS13CQ709C8 3753 aa7□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 Q6ZRP5 223 aa7□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 CXCL6P80162 114 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 CASC10Q5T4H9 136 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 FAM168BA1KXE4 195 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 BCE1O60756 84 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 RTL8CO15255 209 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 PRR15Q8IV56 129 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 SMIM29Q86T20 159 aa6.98□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.97□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.97□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.97□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 C16orf90A8MZG2 172 aa6.96□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 MP68P56378 58 aa6.96□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
TOP3B-210ENST00000444502 VPREB1P12018 145 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 VWFP04275 2813 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 C15orf56Q8N910 161 aa6.96□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 Q9BRP9 147 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 IGLV6-57P01721 117 aa6.95□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TOP3B-210ENST00000444502 HCG22E2RYF7 251 aa6.94□□□□□ -1.3
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