RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 Q6ZTC4 211 aa11.31□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.31□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.29□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 IGLV6-57P01721 117 aa11.29□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.29□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 OCR1Q9BZK8 76 aa11.29□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.28□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 CELA1Q9UNI1 258 aa11.28□□□□□ -0.6
CNGA3-205ENST00000436404 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.27□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 LYRM9A8MSI8 78 aa11.26□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 DEFB130BP0DP73 79 aa11.25□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 DEFB130AP0DP74 79 aa11.25□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 IGKV4-1P06312 121 aa11.25□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 PRR15Q8IV56 129 aa11.24□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 COX7BP24311 80 aa11.24□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.23□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 COL7A1Q02388 2944 aa11.23□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 Q8N9L7 120 aa11.23□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 DIRC1Q969H9 104 aa11.22□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.22□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.21□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 B9D2Q9BPU9 175 aa11.21□□□□□ -0.61
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0J9YWU9 116 aa11.2□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 GYPEP15421 78 aa11.2□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 PMAIP1Q13794 54 aa11.19□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 hDV103S1A0JD37 113 aa11.18□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 DAD1P61803 113 aa11.18□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 C10orf25Q5T742 122 aa11.18□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.18□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.17□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 Q6ZRU5 148 aa11.17□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 Q1T7F1 81 aa11.17□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CNGA3-205ENST00000436404 REG3AQ06141 175 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 SPAG11BQ08648 103 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 Q6ZRP5 223 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 A0A096LPF7 62 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.11□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 PRO0255Q9UI72 69 aa11.11□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 LCE6AA0A183 80 aa11.1□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.1□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 HTN3P15516 51 aa11.1□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.1□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.09□□□□□ -0.63
CNGA3-205ENST00000436404 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.08□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.08□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 SMIM29Q86T20 159 aa11.06□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.06□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 KLK12Q9UKR0 248 aa11.06□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 FBN3Q75N90 2809 aa11.05□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 C3orf84H3BNL1 204 aa11.05□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.04□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.02□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 PSPHP1O15172 72 aa11.02□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.02□□□□□ -0.64
CNGA3-205ENST00000436404 VPREB1P12018 145 aa11□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 H3BNG1 76 aa11□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 M0R378 163 aa11□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.98□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1B0GW54 56 aa10.97□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.97□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 CD164Q04900 197 aa10.96□□□□□ -0.65
CNGA3-205ENST00000436404 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.95□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 PSCAO43653 123 aa10.95□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 PRR34Q9NV39 138 aa10.94□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 Q8N377 158 aa10.92□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 A8MUN3 132 aa10.91□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 SYCNQ0VAF6 134 aa10.91□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.91□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 STARD9Q9P2P6 4700 aa10.9□□□□□ -0.66
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PNM2 257 aa10.89□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 PRR4Q16378 134 aa10.89□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 LELP1Q5T871 98 aa10.89□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFB1O75438 58 aa10.88□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.88□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 TGP01266 2768 aa10.88□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 LYSTQ99698 3801 aa10.88□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 DSCR10P59022 87 aa10.87□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.87□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 Q5VV11 94 aa10.86□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 UBE2BP63146 152 aa10.86□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 APLNQ9ULZ1 77 aa10.85□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 K7EQZ3 153 aa10.84□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.84□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 Q8NBF4 154 aa10.84□□□□□ -0.67
CNGA3-205ENST00000436404 A8MU10 97 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 273.3 ms