RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0J9YXY3	114 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZRX8	168 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SPINK1	P00995	79 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	NPC2	P61916	151 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	LITAF	Q99732	161 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01545	Q5VT33	79 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	MOBP	Q13875	183 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM17B	O60830	172 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	PET117	Q6UWS5	81 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXC	Q9NY87	97 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf52	A6NGY3	159 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8N377	158 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf79	P0CE67	100 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF815P	A8K554	130 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A6	P06703	90 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTDAP	P60985	99 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		9.93	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		9.92	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR1B	P22528	89 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A2	P29034	98 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A20	O43772	301 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		9.89	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		9.89	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		9.89	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	9.87	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf99	Q4VX62	202 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	COX7B	P24311	80 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf202	A1L168	122 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ATOH7	Q8N100	152 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	IFITM1	P13164	125 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZVH6	145 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	XP32	Q5T750	250 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	COPS9	Q8WXC6	57 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	PCP2	Q8IVA1	136 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	AKR1D1	P51857	326 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	LIMD2	Q9BT23	127 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GWB2	263 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TAL2	Q16559	108 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM29	Q86T20	159 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SCGB1D1	O95968	90 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CD164	Q04900	197 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738		Q1RN00	199 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NDN8	102 aa		9.73	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PRO1933	Q9H354	126 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		9.71	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738		A4D1N5	150 aa		9.71	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738		Q5XG85	94 aa		9.7	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE2C	Q5TA81	110 aa		9.69	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		9.69	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738		H7C2G1	150 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0G2JQZ4	141 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf92	A6NGG3	77 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PYY3	Q5JQD4	70 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf195	Q5TG92	126 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00575	Q6W349	94 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		9.6	□□□□□ -0.87

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