RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.59□□□□□ -1.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GV90 55 aa7.58□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD52Q0P140 79 aa7.58□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.58□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIGD1BQ9P298 99 aa7.58□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BRM9 83 aa7.57□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.57□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.57□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.56□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM126AQ9H061 195 aa7.56□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM238C9JI98 176 aa7.55□□□□□ -1.2
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.55□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM223A0PJW6 202 aa7.55□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPREB1P12018 145 aa7.55□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFN2P35080 140 aa7.55□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.55□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF815PA8K554 130 aa7.54□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R378 163 aa7.53□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEPROTO15243 131 aa7.53□□□□□ -1.2
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAL2Q16559 108 aa7.53□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XP32Q5T750 250 aa7.53□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.53□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.53□□□□□ -1.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QQQ9 107 aa7.52□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.52□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERG28Q9UKR5 140 aa7.52□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.51□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NDN8 102 aa7.51□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.5□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H4GQ99525 98 aa7.5□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.5□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.49□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX17Q14061 63 aa7.49□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEND1Q8N111 149 aa7.49□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8NDZ9 215 aa7.49□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR4Q96PI1 79 aa7.49□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAX1BP3O14907 124 aa7.48□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFTA2Q6UW10 78 aa7.48□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FXYD2P54710 66 aa7.47□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.47□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM13P0DJ93 91 aa7.46□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.46□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.45□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZVH6 145 aa7.44□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8NBF4 154 aa7.44□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.44□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.44□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAND5Q8N907 189 aa7.43□□□□□ -1.22
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf118A6NHY6 69 aa7.43□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAMP3Q15836 100 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB37Q96AX2 223 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.42□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRYO14603 147 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK1P00995 79 aa7.41□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GWB2 263 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7ERJ3 54 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00158P58513 81 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERV-K104P63124 156 aa7.4□□□□□ -1.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BUT2 72 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM17BO60830 172 aa7.39□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0U1RRA0 63 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR1AP35321 89 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2V1Q13404 147 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.38□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00483Q53H64 154 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LITAFQ99732 161 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPANXCQ9NY87 97 aa7.37□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPM0 123 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCR3O14931 201 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP2P12104 132 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.36□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A4D1N5 150 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFITM1P13164 125 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.35□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOBPQ13875 183 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N377 158 aa7.34□□□□□ -1.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0B4J2C4 111 aa7.33□□□□□ -1.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.33□□□□□ -1.24
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