RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ESRGQ1W209 222 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SCXQ7RTU7 201 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS28P62857 69 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BNG1 76 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZRP5 223 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL6P80162 114 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV7A0A075B6U4 112 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 OXTP01178 125 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SYCNQ0VAF6 134 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 BCE1O60756 84 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SNURFQ9Y675 71 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N9L7 120 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf33Q8WU49 177 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 H7BZZ5 65 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM236CP0DP71 79 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RMI2Q96E14 147 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf84H3BNL1 204 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 KLKP1Q107X0 134 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NREPQ16612 68 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N377 158 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 F8WDY8 70 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TGP01266 2768 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM168BA1KXE4 195 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH10Q8IVF4 4471 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 BPY2O14599 106 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CASC10Q5T4H9 136 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 F8WEM9 126 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV4-1P06312 121 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 Q9BRP9 147 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf26Q17RF5 130 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZRX8 168 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TLX1NBP0CAT3 122 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 Q5XG85 94 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf47Q569G3 176 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SERP1Q9Y6X1 66 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PRYO14603 147 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM254Q8TBM7 123 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PNM2 257 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf137Q5JT78 98 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR1AP35321 89 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ERC2-IT1O76042 136 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 OCR1Q9BZK8 76 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFC1O43677 76 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 EPM2AB3EWF7 344 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 TNP2Q05952 138 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2BP63146 152 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 FBN3Q75N90 2809 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8NBF4 154 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM29Q86T20 159 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 B9D2Q9BPU9 175 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0U1RQV1 116 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GW54 56 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 REG3GQ6UW15 175 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JQZ4 141 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PNN7 141 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR4Q96PI1 79 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.84□□□□□ -0.51
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