RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.01□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 C10orf25Q5T742 122 aa12□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.99□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 CCL18P55774 89 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 HAMPP81172 84 aa11.96□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0087Q14695 138 aa11.96□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.96□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.96□□□□□ -0.49
PDE4D-204ENST00000358923 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.96□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 PMAIP1Q13794 54 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 PRR34Q9NV39 138 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 FBN3Q75N90 2809 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.91□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 SPAG11BQ08648 103 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 CASC10Q5T4H9 136 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 Q8N814 137 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00167Q96N53 147 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 Q8IZM0 81 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4D-204ENST00000358923 Q8NDZ9 215 aa11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 H3BNG1 76 aa11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZVQ6 151 aa11.87□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PRR15Q8IV56 129 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.85□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZQT0 140 aa11.85□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.85□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 NREPQ16612 68 aa11.84□□□□□ -0.51
PDE4D-204ENST00000358923 KMT2AQ03164 3969 aa11.83□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 CXCL6P80162 114 aa11.82□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 M0R2N4 97 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 C15orf56Q8N910 161 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZRU5 148 aa11.8□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.8□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 SCXQ7RTU7 201 aa11.79□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 B9D2Q9BPU9 175 aa11.79□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.78□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.78□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 PRYO14603 147 aa11.77□□□□□ -0.52
PDE4D-204ENST00000358923 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.77□□□□□ -0.53
PDE4D-204ENST00000358923 BPY2O14599 106 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-204ENST00000358923 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-204ENST00000358923 ERC2-IT1O76042 136 aa11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-204ENST00000358923 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-204ENST00000358923 CD164Q04900 197 aa11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-204ENST00000358923 C6orf99Q4VX62 202 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 PDE6GP18545 87 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 APLNQ9ULZ1 77 aa11.68□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00575Q6W349 94 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZRP5 223 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 COX17Q14061 63 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-204ENST00000358923 Q1T7F1 81 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 hDV103S1A0JD37 113 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 PSPHP1O15172 72 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 MUC7Q8TAX7 377 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 DNAH2Q9P225 4427 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SYCNQ0VAF6 134 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 FAM168BA1KXE4 195 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 OCR1Q9BZK8 76 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 Q8N9L7 120 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZQY7 126 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 PSCAO43653 123 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.55□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 IGKV4-1P06312 121 aa11.55□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 H3BQ85 93 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 VPREB1P12018 145 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.52□□□□□ -0.56
PDE4D-204ENST00000358923 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.52□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.52□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 IGLV6-57P01721 117 aa11.49□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.49□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 NUPR2A6NF83 97 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 A8MUN3 132 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 COX7BP24311 80 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-204ENST00000358923 CHTF8P0CG12 524 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms