RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 UPK3BQ9BT76 320 aa4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 TRACP01848 142 aa4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 DPH3Q96FX2 82 aa4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 LINC00167Q96N53 147 aa4.62□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 H3BT86 120 aa4.61□□□□□ -1.67
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RAD9B-201ENST00000358071 H0YGX0 51 aa4.59□□□□□ -1.67
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RAD9B-201ENST00000358071 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.58□□□□□ -1.68
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RAD9B-201ENST00000358071 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.56□□□□□ -1.68
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RAD9B-201ENST00000358071 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.56□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.56□□□□□ -1.68
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RAD9B-201ENST00000358071 TNP2Q05952 138 aa4.55□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 RMI2Q96E14 147 aa4.55□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.54□□□□□ -1.68
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RAD9B-201ENST00000358071 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.54□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 SNCGO76070 127 aa4.54□□□□□ -1.68
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RAD9B-201ENST00000358071 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.54□□□□□ -1.68
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RAD9B-201ENST00000358071 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.53□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 PRO0628Q9UI54 55 aa4.53□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 FAT1Q14517 4588 aa4.53□□□□□ -1.68
RAD9B-201ENST00000358071 B5MCH6 92 aa4.52□□□□□ -1.69
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RAD9B-201ENST00000358071 Q6ZRX8 168 aa4.52□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 Q8N9L7 120 aa4.52□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.52□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.52□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 LINC01600Q96MT4 127 aa4.52□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.51□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.51□□□□□ -1.69
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RAD9B-201ENST00000358071 RTL8CO15255 209 aa4.5□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 Q6ZR54 194 aa4.5□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.5□□□□□ -1.69
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RAD9B-201ENST00000358071 Q6ZQT0 140 aa4.5□□□□□ -1.69
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RAD9B-201ENST00000358071 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.49□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.49□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.49□□□□□ -1.69
RAD9B-201ENST00000358071 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.49□□□□□ -1.69
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RAD9B-201ENST00000358071 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.47□□□□□ -1.69
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RAD9B-201ENST00000358071 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.46□□□□□ -1.69
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