RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 A0A0J9YXV3 536 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 MUC7Q8TAX7 377 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 IGHV3-53P01767 116 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 HTN3P15516 51 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 TSHBP01222 138 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 A0A1B0GW54 56 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 NUPR2A6NF83 97 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 PDE6GP18545 87 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 PRO0255Q9UI72 69 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 H3BNG1 76 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 LINC00315P59091 139 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 Q8N3U1 123 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 J3QL48 77 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 Q6ZSN1 163 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 F5H697 171 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 BPY2O14599 106 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 LCE6AA0A183 80 aa4.71□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 K7EQD1 137 aa4.71□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 NDUFB1O75438 58 aa4.71□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 CASC2Q6XLA1 102 aa4.71□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
CS-201ENST00000351328 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 A6NED7 52 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 NDUFA1O15239 70 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 CASC10Q5T4H9 136 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 LINC00167Q96N53 147 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 H3BQ85 93 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 M0QY20 66 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 MOBPQ13875 183 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 OCR1Q9BZK8 76 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 APLNQ9ULZ1 77 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 A0A096LPF7 62 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 Q9BRP9 147 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 NCR3O14931 201 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 A8MU10 97 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 CRPP02741 224 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 PRR15LQ9BU68 103 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 CCL18P55774 89 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 TENM2Q9NT68 2774 aa4.65□□□□□ -1.66
CS-201ENST00000351328 HAMPP81172 84 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 LELP1Q5T871 98 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 Q6ZQT0 140 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 A0A087WYN8 130 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 LECT2O14960 151 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 LYSTQ99698 3801 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 LY6G6CO95867 125 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 Q8N814 137 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-201ENST00000351328 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms