RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GINS3-201ENST00000318129 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.84□□□□□ -1.31
GINS3-201ENST00000318129 Q8N814 137 aa6.84□□□□□ -1.31
GINS3-201ENST00000318129 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 NDUFC1O43677 76 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 REG3AQ06141 175 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZQT0 140 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 KLK12Q9UKR0 248 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 Q8N3U1 123 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 PRR34Q9NV39 138 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 DNAH2Q9P225 4427 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 C3orf84H3BNL1 204 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 HAMPP81172 84 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZVQ6 151 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 M0R2N4 97 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 CXCL6P80162 114 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-201ENST00000318129 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 CASC10Q5T4H9 136 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 RYR3Q15413 4870 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WZ39 114 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 C6orf223Q8N319 242 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 ERC2-IT1O76042 136 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 NREPQ16612 68 aa6.73□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 LINC00575Q6W349 94 aa6.73□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.71□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.71□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.71□□□□□ -1.33
GINS3-201ENST00000318129 C6orf99Q4VX62 202 aa6.71□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.71□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 PDE6GP18545 87 aa6.7□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.7□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 PRR15Q8IV56 129 aa6.7□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 BPY2O14599 106 aa6.7□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 PMAIP1Q13794 54 aa6.69□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 PRYO14603 147 aa6.69□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZRU5 148 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 SCXQ7RTU7 201 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 LY6G6CO95867 125 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 Q8IZM0 81 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 OCR1Q9BZK8 76 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 Q8NDZ9 215 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 PKHD1P08F94 4074 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZR54 194 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.65□□□□□ -1.34
GINS3-201ENST00000318129 PSCAO43653 123 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 SPAG11BQ08648 103 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 COX17Q14061 63 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 KIAA0087Q14695 138 aa6.65□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 H3BQ85 93 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZQY7 126 aa6.64□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 hDV103S1A0JD37 113 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 Q1T7F1 81 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 C15orf56Q8N910 161 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 IGKV4-1P06312 121 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 C14orf177Q52M58 125 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 RYR2Q92736 4967 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZRP5 223 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 Q8N9L7 120 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 IGLV6-57P01721 117 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS3-201ENST00000318129 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.59□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 LCE6AA0A183 80 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 SYCNQ0VAF6 134 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 COX7BP24311 80 aa6.57□□□□□ -1.36
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