RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.02□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 BPY2O14599 106 aa9.01□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 Q6ZTC4 211 aa9.01□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 PMAIP1Q13794 54 aa9□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.99□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.98□□□□□ -0.97
CTDP1-202ENST00000299543 DIRC1Q969H9 104 aa8.98□□□□□ -0.97
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CTDP1-202ENST00000299543 A0A0J9YWU9 116 aa8.98□□□□□ -0.97
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CTDP1-202ENST00000299543 LINC00167Q96N53 147 aa8.97□□□□□ -0.97
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CTDP1-202ENST00000299543 A8MU10 97 aa8.97□□□□□ -0.97
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CTDP1-202ENST00000299543 Q6ZRU5 148 aa8.96□□□□□ -0.97
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CTDP1-202ENST00000299543 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.95□□□□□ -0.98
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CTDP1-202ENST00000299543 KRTAP10-11P60412 298 aa8.92□□□□□ -0.98
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CTDP1-202ENST00000299543 C15orf56Q8N910 161 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTDP1-202ENST00000299543 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTDP1-202ENST00000299543 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CTDP1-202ENST00000299543 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.83□□□□□ -1
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CTDP1-202ENST00000299543 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.78□□□□□ -1
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CTDP1-202ENST00000299543 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.78□□□□□ -1
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CTDP1-202ENST00000299543 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 IGKV4-1P06312 121 aa8.76□□□□□ -1.01
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CTDP1-202ENST00000299543 PRR15Q8IV56 129 aa8.75□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.74□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 hDV103S1A0JD37 113 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.73□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.72□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 UBE2BP63146 152 aa8.71□□□□□ -1.01
CTDP1-202ENST00000299543 Q8N377 158 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 TENM2Q9NT68 2774 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 CD164Q04900 197 aa8.69□□□□□ -1.02
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CTDP1-202ENST00000299543 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.69□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 A6NED7 52 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 A0A0G2JQZ4 141 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 A0A1W2PNN7 141 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 Q9BRP9 147 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 ERC2-IT1O76042 136 aa8.65□□□□□ -1.02
CTDP1-202ENST00000299543 Q6ZRX8 168 aa8.65□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 C1orf137Q5JT78 98 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 LINC00208Q96KT6 92 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 PSCAO43653 123 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDP1-202ENST00000299543 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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