RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 PSCAO43653 123 aa7.2□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 ACYP1P07311 99 aa7.19□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.19□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZRP5 223 aa7.19□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 SYCNQ0VAF6 134 aa7.18□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.18□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.18□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 EPM2AB3EWF7 344 aa7.17□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.17□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 A0A087WVE0 104 aa7.17□□□□□ -1.26
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GGPS1-201ENST00000282841 COX17Q14061 63 aa7.16□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 COPS9Q8WXC6 57 aa7.16□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.16□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 FAM168BA1KXE4 195 aa7.15□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.15□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 MUC7Q8TAX7 377 aa7.15□□□□□ -1.26
GGPS1-201ENST00000282841 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.15□□□□□ -1.26
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GGPS1-201ENST00000282841 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.15□□□□□ -1.27
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GGPS1-201ENST00000282841 C20orf197Q8N268 126 aa7.15□□□□□ -1.27
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GGPS1-201ENST00000282841 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.14□□□□□ -1.27
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GGPS1-201ENST00000282841 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGPS1-201ENST00000282841 C6orf99Q4VX62 202 aa7.09□□□□□ -1.27
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GGPS1-201ENST00000282841 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.07□□□□□ -1.28
GGPS1-201ENST00000282841 H7BZZ5 65 aa7.07□□□□□ -1.28
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GGPS1-201ENST00000282841 C14orf177Q52M58 125 aa6.96□□□□□ -1.29
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00575Q6W349 94 aa6.96□□□□□ -1.29
GGPS1-201ENST00000282841 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.96□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 C8orf87E5RJ46 101 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 HAMPP81172 84 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZQY7 126 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00846Q9NV44 126 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 COX7BP24311 80 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.95□□□□□ -1.3
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