RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270815.4

C1orf216-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 216, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf216, Length 3,218 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf216-201ENST00000270815 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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C1orf216-201ENST00000270815 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
C1orf216-201ENST00000270815 LELP1Q5T871 98 aa8.49□□□□□ -1.05
C1orf216-201ENST00000270815 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.49□□□□□ -1.05
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C1orf216-201ENST00000270815 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.48□□□□□ -1.05
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C1orf216-201ENST00000270815 VPREB1P12018 145 aa8.42□□□□□ -1.06
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C1orf216-201ENST00000270815 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.075e-6■■■□□ 16.6
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C1orf216-201ENST00000270815 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.35□□□□□ -1.07
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C1orf216-201ENST00000270815 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.34□□□□□ -1.07
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C1orf216-201ENST00000270815 C1orf195Q5TG92 126 aa8.23□□□□□ -1.09
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C1orf216-201ENST00000270815 CASC10Q5T4H9 136 aa8.2□□□□□ -1.1
C1orf216-201ENST00000270815 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.2□□□□□ -1.1
C1orf216-201ENST00000270815 Q8NBF4 154 aa8.2□□□□□ -1.1
C1orf216-201ENST00000270815 DSCR10P59022 87 aa8.19□□□□□ -1.1
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C1orf216-201ENST00000270815 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.15□□□□□ -1.1
C1orf216-201ENST00000270815 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.15□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 TNP2Q05952 138 aa8.14□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 PSCAO43653 123 aa8.14□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 HCG22E2RYF7 251 aa8.13□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 K7EIL1 84 aa8.12□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.12□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
C1orf216-201ENST00000270815 SPRR4Q96PI1 79 aa8.11□□□□□ -1.11
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