RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 hADV29S1A0JD25 119 aa6.95□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 C6orf99Q4VX62 202 aa6.95□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZR54 194 aa6.95□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZRP5 223 aa6.95□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.95□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.95□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.94□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.94□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 LECT2O14960 151 aa6.94□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 DIRC1Q969H9 104 aa6.94□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 A0A087WYN8 130 aa6.93□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 NCR3O14931 201 aa6.93□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.93□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 Q8NDZ9 215 aa6.92□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.92□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.91□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 PDE6GP18545 87 aa6.91□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 COX7BP24311 80 aa6.91□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 CDIP1Q9H305 208 aa6.91□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 C22orf24Q9Y442 160 aa6.91□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 PSCAO43653 123 aa6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 SLPIP03973 132 aa6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 GAGE2EQ4V326 116 aa6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.9□□□□□ -1.3
CDCA3-201ENST00000229265 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.89□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 FAT1Q14517 4588 aa6.88□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 TNP2Q05952 138 aa6.88□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 Q6Q795 121 aa6.88□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.88□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.87□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 C16orf90A8MZG2 172 aa6.87□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 PRYO14603 147 aa6.87□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 IMUPQ9GZP8 106 aa6.87□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.87□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 SPRR1AP35321 89 aa6.86□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.86□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.86□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 CCKP06307 115 aa6.85□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00643Q86TS7 51 aa6.85□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.85□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 PCP4P48539 62 aa6.84□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 C7orf33Q8WU49 177 aa6.84□□□□□ -1.31
CDCA3-201ENST00000229265 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.83□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1B0GW54 56 aa6.83□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.83□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 GAGE2BQ13066 116 aa6.83□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP10-2P60368 255 aa6.82□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 XGP55808 180 aa6.81□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.81□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZQY7 126 aa6.81□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 DSCR8Q96T75 97 aa6.8□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.8□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.8□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.8□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 EPM2AB3EWF7 344 aa6.79□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 B5MCH6 92 aa6.79□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 H0Y9J4 135 aa6.79□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZRX8 168 aa6.79□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 MT-ATP8P03928 68 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.78□□□□□ -1.32
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 REG3GQ6UW15 175 aa6.77□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.77□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.77□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZQT0 140 aa6.76□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.75□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 A0A096LNI7 61 aa6.75□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.75□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.75□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.75□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 A0A087WTM6 91 aa6.74□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 UBL5Q9BZL1 73 aa6.74□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 HERC1Q15751 4861 aa6.73□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 FAM168BA1KXE4 195 aa6.73□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 Q6JHZ5 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PNN7 141 aa6.72□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00846Q9NV44 126 aa6.72□□□□□ -1.33
CDCA3-201ENST00000229265 HAMPP81172 84 aa6.71□□□□□ -1.34
CDCA3-201ENST00000229265 Q8N377 158 aa6.71□□□□□ -1.34
CDCA3-201ENST00000229265 MYCBP2O75592 4640 aa6.7□□□□□ -1.34
CDCA3-201ENST00000229265 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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