RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.73□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 ESRGQ1W209 222 aa6.73□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 A8MU10 97 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 Q8IZM0 81 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 COPS9Q8WXC6 57 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 A0A087WYN8 130 aa6.71□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 Q8NDZ9 215 aa6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 Q6ZRU5 148 aa6.7□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 PRR15Q8IV56 129 aa6.7□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 LECT2O14960 151 aa6.7□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.69□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 PSPHP1O15172 72 aa6.68□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.67□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 Q6JHZ5 121 aa6.67□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 C22orf24Q9Y442 160 aa6.67□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.66□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.66□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 PRR34Q9NV39 138 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C6orf99Q4VX62 202 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 B9D2Q9BPU9 175 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 CASC10Q5T4H9 136 aa6.63□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.63□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TGP01266 2768 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C8orf87E5RJ46 101 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 KMT2AQ03164 3969 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.61□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.61□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.6□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.6□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C15orf56Q8N910 161 aa6.6□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 KLKP1Q107X0 134 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 M0R378 163 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 H0YGX0 51 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 COX17Q14061 63 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 DNAH2Q9P225 4427 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.57□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 Q6ZRP5 223 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 H3BNG1 76 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 Q8N814 137 aa6.55□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 SYCNQ0VAF6 134 aa6.55□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 RYR2Q92736 4967 aa6.54□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 FAM168BA1KXE4 195 aa6.54□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.54□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 Q6ZQY7 126 aa6.53□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.53□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 HAMPP81172 84 aa6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 A8MUN3 132 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 RYR3Q15413 4870 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 VPREB1P12018 145 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 LINC00575Q6W349 94 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DIRC1Q969H9 104 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 IGLV6-57P01721 117 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 PSCAO43653 123 aa6.49□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 SCXQ7RTU7 201 aa6.49□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 M0R2N4 97 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 PRR4Q16378 134 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 COX7BP24311 80 aa6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 UBL5Q9BZL1 73 aa6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 NDUFC1O43677 76 aa6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 C7orf33Q8WU49 177 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 Q6ZVQ6 151 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 C16orf90A8MZG2 172 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 PKD1P98161 4303 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms