RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	TAL2	Q16559	108 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	ATOH7	Q8N100	152 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC01549	A6NIU2	74 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	UBE2L6	O14933	153 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	PRELID3A	Q96N28	172 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A096LNI7	61 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658		H7C1H1	209 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658		K7EP34	96 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP5L	O75964	103 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	FCER1G	P30273	86 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	CACNG7	P62955	275 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658		D6R8Y8	96 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658		Q8N8P6	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC01600	Q96MT4	127 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1B0GWB2	263 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1W2PPM0	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		F8W1H4	67 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	CKS2	P33552	79 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	XCL1	P47992	114 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		Q6ZVH6	145 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	NCR2	O95944	276 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	PPP1R17	O96001	155 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	FABP2	P12104	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	MRAP2	Q96G30	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0J9YXV3	536 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		E9PLD3	99 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		J3QR89	54 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	DPM2	O94777	84 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	NPY	P01303	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	IGKC	P01834	107 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	PLN	P26678	52 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	C20orf78	Q9BR46	151 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	LPA	P08519	4548 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	CEND1	Q8N111	149 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		H3BUT2	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1W2PNN7	141 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		F8VRH5	84 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		I3L3M4	83 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658		M0QXV9	152 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	PCP2	Q8IVA1	136 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	VCX2	Q9H322	139 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	SS18	Q15532	418 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	TOMM6	Q96B49	74 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	NMU	P48645	174 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	FXYD2	P54710	66 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MFSD8-240	ENST00000641658	C5orf38	Q86SI9	138 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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