RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608669.1

LINC00963-212, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-212ENST00000608669 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 NPC2P61916 151 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 E9PLD3 99 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 C22orf24Q9Y442 160 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 C20orf202A1L168 122 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 C5orf52A6NGY3 159 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 UBE2BP63146 152 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 NMUP48645 174 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 C1orf137Q5JT78 98 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 NCR3O14931 201 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00963-212ENST00000608669 A0A0J9YXY3 114 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 ZNF815PA8K554 130 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 VPREB1P12018 145 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 MYCBP2O75592 4640 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 SCGB1D1O95968 90 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 IGKV2D-28P01615 120 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 HERV-K104P63124 156 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 PCP2Q8IVA1 136 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 LINC00167Q96N53 147 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 COX17Q14061 63 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 SFTA2Q6UW10 78 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 TMEM238C9JI98 176 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 LITAFQ99732 161 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00963-212ENST00000608669 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 IGLV7-43P04211 117 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 PRLHP81277 87 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 LINC00587B1AMM8 73 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 J3QL48 77 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 M0R378 163 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 BCE1O60756 84 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 TMEM126AQ9H061 195 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00963-212ENST00000608669 UBE2AP49459 152 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 SPATA45Q537H7 98 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 REG3GQ6UW15 175 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 C14orf144Q96I85 54 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 AKR1D1P51857 326 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 PYY3Q5JQD4 70 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 H0Y9J4 135 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 TIMM17BO60830 172 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 DDTP30046 118 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 VAMP8Q9BV40 100 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 ZNF861PO60384 105 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 MT1HL1P0DM35 61 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 SPANXCQ9NY87 97 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 DIRC1Q969H9 104 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 PRYO14603 147 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 COX8AP10176 69 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 C12orf57Q99622 126 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00963-212ENST00000608669 NDUFC2O95298 119 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00963-212ENST00000608669 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00963-212ENST00000608669 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00963-212ENST00000608669 OXTP01178 125 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00963-212ENST00000608669 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms