RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 A0A0U1RRA0 63 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 TIMM17BO60830 172 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 SMIM13P0DJ93 91 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 LITAFQ99732 161 aa6.83□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00587B1AMM8 73 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM238C9JI98 176 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 PFN2P35080 140 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00158P58513 81 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.82□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 DDTP30046 118 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 COX17Q14061 63 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 DAND5Q8N907 189 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 SPANXCQ9NY87 97 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 HSD52Q0P140 79 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 Q8N1X5 172 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 HIST1H4GQ99525 98 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 NPC2P61916 151 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 CTAG1AP78358 180 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 TAL2Q16559 108 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 Q6ZVH6 145 aa6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-209ENST00000592170 PKD1P98161 4303 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 Q6ZRP5 223 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.77□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 IFITM1P13164 125 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 GCSHP23434 173 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 LINC01620Q4KN68 170 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 GAGE2EQ4V326 116 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 CEND1Q8N111 149 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.76□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 PTTG1IPP53801 180 aa6.75□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 COPS9Q8WXC6 57 aa6.75□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.75□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 FXYD2P54710 66 aa6.74□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 GAGE2BQ13066 116 aa6.74□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.74□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 A0A096LNI7 61 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 B5MCH6 92 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 M0R143 59 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.73□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 A0A1B0GVY2 172 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 A4D1N5 150 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 C16orf90A8MZG2 172 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-209ENST00000592170 PKHD1P08F94 4074 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 CHTF8P0CG12 524 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 Q8NDZ9 215 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 BATFQ16520 125 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 NDUFC2O95298 119 aa6.69□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 VPREB1P12018 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 FAM168BA1KXE4 195 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 PANO1I0J062 215 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 NCR3O14931 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV2D-28P01615 120 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 CFC1BP0CG36 223 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 CFC1P0CG37 223 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.68□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 K7ERJ3 54 aa6.67□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.67□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SEH1L-209ENST00000592170 A0A0B4J2C4 111 aa6.66□□□□□ -1.34
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