RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-210	ENST00000588340	TNXB	P22105	4242 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340		A0A1W2PNN7	141 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340		H3BRM9	83 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	PLN	P26678	52 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	PRSS2	P07478	247 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	DPM2	O94777	84 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	FABP4	P15090	132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	PCP4	P48539	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	NDUFA6	P56556	154 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	CKS1B	P61024	79 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	COX17	Q14061	63 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFTUD2-210	ENST00000588340	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340		E9PLD3	99 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	LEPROT	O15243	131 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGKC	P01834	107 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	NMU	P48645	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	HERV-K104	P63124	156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340		Q8NDZ9	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340		J3QQQ9	107 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	VPREB1	P12018	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340		M0QXV9	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	AKR1D1	P51857	326 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	LITAF	Q99732	161 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340		H0Y8G0	127 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	HERVK_113	P61574	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	UBE2B	P63146	152 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	LRP2	P98164	4655 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFTUD2-210	ENST00000588340	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	TIMM17B	O60830	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	KRTDAP	P60985	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340		A0A0J9YXY3	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340		H0Y9J4	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	PFN2	P35080	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	C20orf202	A1L168	122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	NDUFC2	O95298	119 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	SPRR1A	P35321	89 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	S100A6	P06703	90 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFTUD2-210	ENST00000588340	S100A2	P29034	98 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.6 ms