RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA0087Q14695 138 aa16.33■□□□□ 0.2
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRR3P79522 188 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C15orf56Q8N910 161 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa15.92■□□□□ 0.14
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBL5Q9BZL1 73 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZQY7 126 aa15.88■□□□□ 0.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZRU5 148 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 B9D2Q9BPU9 175 aa15.86■□□□□ 0.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BQ85 93 aa15.8■□□□□ 0.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DSCR8Q96T75 97 aa15.8■□□□□ 0.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.79■□□□□ 0.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPREB1P12018 145 aa15.79■□□□□ 0.12
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM258P61165 79 aa15.78■□□□□ 0.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASC10Q5T4H9 136 aa15.78■□□□□ 0.12
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