RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.34□□□□□ -0.91
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF815PA8K554 130 aa9.34□□□□□ -0.91
CHTF18-217ENST00000567620 COX8AP10176 69 aa9.34□□□□□ -0.91
CHTF18-217ENST00000567620 PCP2Q8IVA1 136 aa9.34□□□□□ -0.91
CHTF18-217ENST00000567620 C12orf57Q99622 126 aa9.34□□□□□ -0.91
CHTF18-217ENST00000567620 Q6ZRP5 223 aa9.33□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.33□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 MYCBP2O75592 4640 aa9.33□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 LINC00587B1AMM8 73 aa9.32□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 DLEU1O43261 78 aa9.32□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.32□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.32□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 A0A0J9YXY3 114 aa9.3□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.3□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 COX17Q14061 63 aa9.3□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 C14orf144Q96I85 54 aa9.3□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.29□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 ERG28Q9UKR5 140 aa9.29□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 FAM168BA1KXE4 195 aa9.28□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.28□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 TIMM17BO60830 172 aa9.28□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.28□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.28□□□□□ -0.92
CHTF18-217ENST00000567620 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.27□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.27□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.27□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 C1orf137Q5JT78 98 aa9.26□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.26□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 SMIM13P0DJ93 91 aa9.25□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 PFN2P35080 140 aa9.25□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 LINC00158P58513 81 aa9.25□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 REG3GQ6UW15 175 aa9.25□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 HERC1Q15751 4861 aa9.24□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 TMEM238C9JI98 176 aa9.24□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 UBE2BP63146 152 aa9.24□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.24□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 HIGD1BQ9P298 99 aa9.24□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 TSTD3H0UI37 97 aa9.23□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 M0QXV9 152 aa9.23□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 LITAFQ99732 161 aa9.23□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 PRO1933Q9H354 126 aa9.23□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.23□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 Q6ZVH6 145 aa9.22□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.22□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CHTF18-217ENST00000567620 A0A0U1RRA0 63 aa9.21□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.21□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.21□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.21□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.21□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 SPANXCQ9NY87 97 aa9.21□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 MT1HL1P0DM35 61 aa9.2□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 LINC01600Q96MT4 127 aa9.2□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 COPS9Q8WXC6 57 aa9.19□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.19□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.19□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 IGLV7-43P04211 117 aa9.18□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 IFITM1P13164 125 aa9.18□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.18□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 DAND5Q8N907 189 aa9.18□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.18□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.17□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 TAL2Q16559 108 aa9.17□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.17□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.17□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.16□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 DIRC1Q969H9 104 aa9.16□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 HIST1H4GQ99525 98 aa9.16□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 C22orf24Q9Y442 160 aa9.16□□□□□ -0.94
CHTF18-217ENST00000567620 HSD52Q0P140 79 aa9.14□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.13□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.13□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 DDTP30046 118 aa9.12□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 NPC2P61916 151 aa9.12□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 GAGE10A6NGK3 116 aa9.11□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 NDUFC2O95298 119 aa9.11□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 CEND1Q8N111 149 aa9.11□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.11□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.1□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.1□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP10-8P60410 259 aa9.1□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.09□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 H0Y9J4 135 aa9.09□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 CTAG1AP78358 180 aa9.09□□□□□ -0.95
CHTF18-217ENST00000567620 VPREB1P12018 145 aa9.08□□□□□ -0.96
CHTF18-217ENST00000567620 LINC00167Q96N53 147 aa9.08□□□□□ -0.96
CHTF18-217ENST00000567620 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.07□□□□□ -0.96
CHTF18-217ENST00000567620 A4D1N5 150 aa9.07□□□□□ -0.96
CHTF18-217ENST00000567620 A6NJY4 79 aa9.07□□□□□ -0.96
CHTF18-217ENST00000567620 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.07□□□□□ -0.96
CHTF18-217ENST00000567620 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.3 ms