RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 NIT2Q9NQR4 276 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 HERC1Q15751 4861 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00587B1AMM8 73 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 SMIM17P0DL12 118 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 ADIRFQ15847 76 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF56Q15929 161 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 BAGE2Q86Y30 109 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 DPH3Q96FX2 82 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 DERL1Q9BUN8 251 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 OSTCQ9NRP0 149 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 FAT1Q14517 4588 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 IQCJQ1A5X6 159 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.11□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 F2Z2F3 143 aa3.11□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 M0QY20 66 aa3.11□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 MP68P56378 58 aa3.11□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 AP1S3Q96PC3 154 aa3.11□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 V9GYV3 84 aa3.11□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 UBE2L6O14933 153 aa3.09□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 LINC01600Q96MT4 127 aa3.07□□□□□ -1.92
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TMOD3-208ENST00000560725 CNFNQ9BYD5 112 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 R4GN34 69 aa3.06□□□□□ -1.92
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TMOD3-208ENST00000560725 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0B4J2C4 111 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 I3L3M4 83 aa3.04□□□□□ -1.92
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