RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 PMCHL1Q16048 86 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 M0QXV9 152 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 NUPR1O60356 82 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 UBE2BP63146 152 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 C1orf137Q5JT78 98 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC01600Q96MT4 127 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 C22orf24Q9Y442 160 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAM168BA1KXE4 195 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 C11orf86A6NJI1 115 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV7-43P04211 117 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 DIRC1Q969H9 104 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM223A0PJW6 202 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 SERF1AO75920 110 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HERV-K104P63124 156 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLNP26678 52 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 ERG28Q9UKR5 140 aa4.62□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF861PO60384 105 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 PFN2P35080 140 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HERVK_113P61574 105 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 DPM2O94777 84 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 MT1HL1P0DM35 61 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00158P58513 81 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP10-8P60410 259 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00167Q96N53 147 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.6□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 H0Y9J4 135 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 BCE1O60756 84 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BKO60814 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BJP06899 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 FABP4P15090 132 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BOP23527 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BBP33778 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 NMUP48645 174 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BDP58876 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BCP62807 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.59□□□□□ -1.67
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 H0Y8G0 127 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 LEPROTO15243 131 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGKCP01834 107 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 AKR1D1P51857 326 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.58□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 SCO1O75880 301 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 S100A12P80511 92 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 PET117Q6UWS5 81 aa4.57□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 J3QQQ9 107 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 M0R378 163 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 VPREB1P12018 145 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.56□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 MYCBP2O75592 4640 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 SMIM13P0DJ93 91 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 UBE2AP49459 152 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.55□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 GAGE10A6NGK3 116 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 E9PLD3 99 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC01545Q5VT33 79 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.54□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A0U1RRA0 63 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 C20orf202A1L168 122 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 MT3P25713 68 aa4.53□□□□□ -1.68
USP3-AS1-206ENST00000560350 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms