RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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CUX1-217ENST00000558836 GAGE2EQ4V326 116 aa7.14□□□□□ -1.27
CUX1-217ENST00000558836 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.14□□□□□ -1.27
CUX1-217ENST00000558836 TTC32Q5I0X7 151 aa7.14□□□□□ -1.27
CUX1-217ENST00000558836 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
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CUX1-217ENST00000558836 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.93□□□□□ -1.3
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CUX1-217ENST00000558836 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-217ENST00000558836 A0A1B0GX51 115 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-217ENST00000558836 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-217ENST00000558836 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-217ENST00000558836 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-217ENST00000558836 M0R378 163 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-217ENST00000558836 COX7BP24311 80 aa6.92□□□□□ -1.3
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