RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF575Q86XF7 245 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N814 137 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-209ENST00000550857 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-209ENST00000550857 ENHOQ6UWT2 76 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRB-209ENST00000550857 CD164Q04900 197 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRB-209ENST00000550857 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 COL6A3P12111 3177 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 TNP2Q05952 138 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 MAST4O15021 2626 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0C4DFX4 3053 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 VPREB1P12018 145 aa5.32□□□□□ -1.56
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