RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF575Q86XF7 245 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N814 137 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00694P0DN24 101 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-209ENST00000550857 V9GYY9 64 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-209ENST00000550857 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 A0A087WYN8 130 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
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PTPRB-209ENST00000550857 YPEL4Q96NS1 127 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 A0A087WSZ3 146 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 Q6Q795 121 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 TRIAP1O43715 76 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-209ENST00000550857 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00575Q6W349 94 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-209ENST00000550857 ENHOQ6UWT2 76 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 C20orf197Q8N268 126 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-209ENST00000550857 C5orf47Q569G3 176 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-209ENST00000550857 SPINK1P00995 79 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRB-209ENST00000550857 IGLV7-43P04211 117 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-209ENST00000550857 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-209ENST00000550857 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-209ENST00000550857 SERP2Q8N6R1 65 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-209ENST00000550857 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-209ENST00000550857 H3BPC8 53 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-209ENST00000550857 UQCRQO14949 82 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRB-209ENST00000550857 CD164Q04900 197 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRB-209ENST00000550857 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA0087Q14695 138 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV2-30P06310 120 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 LAMA1P25391 3075 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 COL6A3P12111 3177 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 TNP2Q05952 138 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 MAST4O15021 2626 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0C4DFX4 3053 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 VPREB1P12018 145 aa5.32□□□□□ -1.56
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