RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BQ85 93 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV6-57P01721 117 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 APOC4P55056 127 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 LELP1Q5T871 98 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 DSCR8Q96T75 97 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 DPH3Q96FX2 82 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 PDE6GP18545 87 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZQY7 126 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 HTN3P15516 51 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 DIRC1Q969H9 104 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR34Q9NV39 138 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 KLK12Q9UKR0 248 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 CELA1Q9UNI1 258 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 MIFP14174 115 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 HAMPP81172 84 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8NAQ8 132 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 BCE1O60756 84 aa6.34□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZVQ6 151 aa6.34□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 MTORP42345 2549 aa6.34□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 C20orf197Q8N268 126 aa6.34□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.34□□□□□ -1.39
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R2N4 97 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 PDZD2O15018 2839 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 COX7BP24311 80 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 CXCL6P80162 114 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 ACANP16112 2415 aa6.32□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 C5orf47Q569G3 176 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 SMR3AQ99954 134 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 OXTP01178 125 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 TENM4Q6N022 2769 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM236CP0DP71 79 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R378 163 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 VPREB1P12018 145 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-202ENST00000546471 KLKP1Q107X0 134 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 VWFP04275 2813 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 HIVEP2P31629 2446 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 H7BZZ5 65 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZRU5 148 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 SCXQ7RTU7 201 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BNG1 76 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 Q5XG85 94 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 C15orf56Q8N910 161 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 SNURFQ9Y675 71 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 ITPR2Q14571 2701 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 C4orf26Q17RF5 130 aa6.23□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 J3QKU1 62 aa6.22□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFC1O43677 76 aa6.22□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 RMI2Q96E14 147 aa6.22□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.22□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 INAFM1C9JVW0 142 aa6.22□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.22□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 F8WDY8 70 aa6.21□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 F8WEM9 126 aa6.21□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 BPY2O14599 106 aa6.21□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 NREPQ16612 68 aa6.21□□□□□ -1.41
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZRP5 223 aa6.21□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 EPM2AB3EWF7 344 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 WIPF1O43516 503 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.19□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 SYCNQ0VAF6 134 aa6.19□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZTC4 211 aa6.19□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 ERC2-IT1O76042 136 aa6.18□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV4-1P06312 121 aa6.18□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 ESRGQ1W209 222 aa6.18□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.18□□□□□ -1.42
RRN3P1-202ENST00000546471 RETNQ9HD89 108 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms