RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.11□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.11□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM223A0PJW6 202 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 OXTP01178 125 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 ERG28Q9UKR5 140 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP6V1G1O75348 118 aa7.09□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 PLNP26678 52 aa7.09□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 SFTA2Q6UW10 78 aa7.09□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.09□□□□□ -1.27
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0U1RRA0 63 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 GAGE10A6NGK3 116 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 DPM2O94777 84 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00158P58513 81 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 C22orf24Q9Y442 160 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A1P23297 94 aa7.07□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 HERVK_113P61574 105 aa7.07□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.07□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.07□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 MYCBP2O75592 4640 aa7.07□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKCP01834 107 aa7.06□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 REG3GQ6UW15 175 aa7.06□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.06□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.06□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.05□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV7-43P04211 117 aa7.05□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 COX17Q14061 63 aa7.05□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.04□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.04□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 LEPROTO15243 131 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM13P0DJ93 91 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 HERV-K104P63124 156 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 J3QQQ9 107 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2D-28P01615 120 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTDAPP60985 99 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 DIRC1Q969H9 104 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00167Q96N53 147 aa7.02□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.01□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00587B1AMM8 73 aa7□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 PET117Q6UWS5 81 aa7□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 H0Y9J4 135 aa6.99□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 VPREB1P12018 145 aa6.99□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2AP49459 152 aa6.99□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 DAND5Q8N907 189 aa6.99□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf202A1L168 122 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 NCR3O14931 201 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 BCE1O60756 84 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 C3orf79P0CE67 100 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 NMUP48645 174 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01545Q5VT33 79 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01600Q96MT4 127 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A2P29034 98 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-208ENST00000533451 E9PLD3 99 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF861PO60384 105 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A6P06703 90 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 MT1HL1P0DM35 61 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8NDZ9 215 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM238C9JI98 176 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 NPC2P61916 151 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 HERC1Q15751 4861 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 M0R378 163 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 ATOH7Q8N100 152 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM126AQ9H061 195 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0J9YXY3 114 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF815PA8K554 130 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 PRLHP81277 87 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A12P80511 92 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.9□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.9□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.9□□□□□ -1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms