RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 UBE2WQ96B02 151 aa5.06□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.06□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 RETNQ9HD89 108 aa5.06□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 A0A0U1RRA0 63 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 PFN2P35080 140 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 LINC00167Q96N53 147 aa5.05□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.04□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.04□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.04□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 B9D2Q9BPU9 175 aa5.04□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 COL6A5A8TX70 2615 aa5.03□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 IGLV6-57P01721 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 SIGMAR1Q99720 223 aa5.03□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.03□□□□□ -1.6
PACS1-211ENST00000531298 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.02□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 DNAL4O96015 105 aa5.02□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.02□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 C15orf56Q8N910 161 aa5.02□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 CLEC2BQ92478 149 aa5.02□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.02□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 DNHD1Q96M86 4753 aa5.01□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.01□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.01□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.01□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.01□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 C10orf25Q5T742 122 aa5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 MTURNQ8N3F0 131 aa5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 OR13C6PQ8NH95 151 aa5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 CDIP1Q9H305 208 aa5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 PKIGQ9Y2B9 76 aa5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 SYCNQ0VAF6 134 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 Q6Q795 121 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 MRAPQ8TCY5 172 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.99□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 M0R378 163 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 VPREB1P12018 145 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 C6orf223Q8N319 242 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 Q8N814 137 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.98□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 ANK2Q01484 3957 aa4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 NUPR2A6NF83 97 aa4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 LINC00575Q6W349 94 aa4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZRU5 148 aa4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 IMUPQ9GZP8 106 aa4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 C22orf24Q9Y442 160 aa4.97□□□□□ -1.61
PACS1-211ENST00000531298 PDE6GP18545 87 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 C14orf177Q52M58 125 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 TTC32Q5I0X7 151 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 DIRC1Q969H9 104 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 APLNQ9ULZ1 77 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 TENM3Q9P273 2699 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 NOTCH1P46531 2555 aa4.96□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 FBN3Q75N90 2809 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WYN8 130 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 LECT2O14960 151 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 C6orf99Q4VX62 202 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.95□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 hADV29S1A0JD25 119 aa4.94□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 LINC00643Q86TS7 51 aa4.94□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.94□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 USP17L23D6RBM5 183 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZRP5 223 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 Q8NDZ9 215 aa4.93□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.92□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 PRYO14603 147 aa4.92□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 NCR3O14931 201 aa4.92□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 COX7BP24311 80 aa4.92□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 XGP55808 180 aa4.92□□□□□ -1.62
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