RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 E9PLD3 99 aa8.67□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 C1orf137Q5JT78 98 aa8.67□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 COX17Q14061 63 aa8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 DIRC1Q969H9 104 aa8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 J3QQQ9 107 aa8.65□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 NMUP48645 174 aa8.65□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 HERV-K104P63124 156 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR4Q16378 134 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1W2PNN7 141 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00587B1AMM8 73 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ERG28Q9UKR5 140 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 GAGE2EQ4V326 116 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.61□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 H0Y9J4 135 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SCGB1D1O95968 90 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV7-43P04211 117 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PFN2P35080 140 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ATOH7Q8N100 152 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.58□□□□□ -1.04
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UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00158P58513 81 aa8.57□□□□□ -1.04
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UBASH3B-202ENST00000525711 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM13P0DJ93 91 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A0J9YXY3 114 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM168BA1KXE4 195 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A0U1RRA0 63 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF815PA8K554 130 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 TIMM17BO60830 172 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.53□□□□□ -1.04
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UBASH3B-202ENST00000525711 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.52□□□□□ -1.05
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UBASH3B-202ENST00000525711 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PCP2Q8IVA1 136 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C22orf24Q9Y442 160 aa8.51□□□□□ -1.05
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UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 LITAFQ99732 161 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 M0QXV9 152 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2BP63146 152 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PYY3Q5JQD4 70 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.49□□□□□ -1.05
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UBASH3B-202ENST00000525711 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.48□□□□□ -1.05
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UBASH3B-202ENST00000525711 DAND5Q8N907 189 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DLEU1O43261 78 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 COX8AP10176 69 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 Q6ZVH6 145 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 VAMP8Q9BV40 100 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM238C9JI98 176 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 NDUFC2O95298 119 aa8.45□□□□□ -1.06
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UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA45Q537H7 98 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 Q8NDZ9 215 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00167Q96N53 147 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SPANXCQ9NY87 97 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.44□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.44□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 M0R378 163 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 IFITM1P13164 125 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 COPS9Q8WXC6 57 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 C14orf144Q96I85 54 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 GAGE10A6NGK3 116 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF861PO60384 105 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-202ENST00000525711 NPC2P61916 151 aa8.39□□□□□ -1.07
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