RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERV-K104	P63124	156 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	C3orf79	P0CE67	100 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERVK_113	P61574	105 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	C1orf137	Q5JT78	98 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131		J3QQQ9	107 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2B	P63146	152 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131		E9PLD3	99 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV7-43	P04211	117 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	VPREB1	P12018	145 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00158	P58513	81 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00587	B1AMM8	73 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM13	P0DJ93	91 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	NMU	P48645	174 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8NDZ9	215 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0U1RRA0	63 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTDAP	P60985	99 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	C20orf202	A1L168	122 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	REG3G	Q6UW15	175 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0J9YXY3	114 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	DIRC1	Q969H9	104 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131		H0Y9J4	135 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF861P	O60384	105 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	BCE1	O60756	84 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A6	P06703	90 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A2	P29034	98 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	AKR1D1	P51857	326 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	DAND5	Q8N907	189 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV2D-28	P01615	120 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	C5orf52	A6NGY3	159 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R378	163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP10-8	P60410	259 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	LITAF	Q99732	161 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATOH7	Q8N100	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM126A	Q9H061	195 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF815P	A8K554	130 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	TIMM17B	O60830	172 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM238	C9JI98	176 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFC2	O95298	119 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	NCR3	O14931	201 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRY	O14603	147 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPRR1A	P35321	89 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2A	P49459	152 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	PCP2	Q8IVA1	136 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRLH	P81277	87 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	LPA	P08519	4548 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPC2	P61916	151 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV6-57	P01721	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	DDT	P30046	118 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPANXC	Q9NY87	97 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCGB1D1	O95968	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZVH6	145 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A12	P80511	92 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFITM1	P13164	125 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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