RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM168BA1KXE4 195 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 NMUP48645 174 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 EPM2AB3EWF7 344 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 COX17Q14061 63 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 Q5VSD8 79 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PNN7 141 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00587B1AMM8 73 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM13P0DJ93 91 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF815PA8K554 130 aa8.44□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 M0QXV9 152 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2BP63146 152 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 DAND5Q8N907 189 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0J9YXY3 114 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 MYCBP2O75592 4640 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE10A6NGK3 116 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 NPC2P61916 151 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 C22orf24Q9Y442 160 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 PCP2Q8IVA1 136 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 VAMP8Q9BV40 100 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 NCR3O14931 201 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM238C9JI98 176 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 VPREB1P12018 145 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf137Q5JT78 98 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TIMM17BO60830 172 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2D-28P01615 120 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA45Q537H7 98 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00167Q96N53 147 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8NDZ9 215 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R378 163 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 PYY3Q5JQD4 70 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 C14orf144Q96I85 54 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 LITAFQ99732 161 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 COPS9Q8WXC6 57 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 COX8AP10176 69 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A12P80511 92 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.26□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SPANXCQ9NY87 97 aa8.26□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.25□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV7-43P04211 117 aa8.25□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.25□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.25□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFC2O95298 119 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 DDTP30046 118 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2AP49459 152 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 REG3GQ6UW15 175 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZVH6 145 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 BCE1O60756 84 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 IFITM1P13164 125 aa8.23□□□□□ -1.09
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