RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502629.1

FBXO38-205, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 2

Gene FBXO38, Length 386 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-205	ENST00000502629	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	UBE2B	P63146	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-205	ENST00000502629	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629		A0A0U1RRA0	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629		A0A0J9YXY3	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	VPREB1	P12018	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	TIMM17B	O60830	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	OXT	P01178	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629		M0R378	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	NDUFC2	O95298	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	ZNF861P	O60384	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	BCE1	O60756	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629		Q6ZVH6	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	DAND5	Q8N907	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629		Q8NDZ9	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	LITAF	Q99732	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-205	ENST00000502629	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	S100A12	P80511	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629		H0Y9J4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629		J3QL48	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	PRY	O14603	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	IFITM1	P13164	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	NCR3	O14931	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	DLEU1	O43261	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	DDT	P30046	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	SPRR1A	P35321	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	UBE2A	P49459	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	NPC2	P61916	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	COX8A	P10176	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-205	ENST00000502629	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FBXO38-205	ENST00000502629	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FBXO38-205	ENST00000502629	PRLH	P81277	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FBXO38-205	ENST00000502629	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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