RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 PDE6GP18545 87 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 SPAG11BQ08648 103 aa7.43□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 C10orf25Q5T742 122 aa7.42□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.42□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 KRTAP10-3P60369 221 aa7.42□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 LRRK2Q5S007 2527 aa7.41□□□□□ -1.22
NEB-215ENST00000489048 PRR34Q9NV39 138 aa7.41□□□□□ -1.22
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NEB-215ENST00000489048 C5orf47Q569G3 176 aa7.41□□□□□ -1.22
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NEB-215ENST00000489048 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.37□□□□□ -1.23
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NEB-215ENST00000489048 Q8NAQ8 132 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEB-215ENST00000489048 C20orf197Q8N268 126 aa7.36□□□□□ -1.23
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NEB-215ENST00000489048 KLKP1Q107X0 134 aa7.35□□□□□ -1.23
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NEB-215ENST00000489048 COX7BP24311 80 aa7.34□□□□□ -1.23
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NEB-215ENST00000489048 FAM236CP0DP71 79 aa7.34□□□□□ -1.23
NEB-215ENST00000489048 Q5XG85 94 aa7.34□□□□□ -1.23
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NEB-215ENST00000489048 H7BZZ5 65 aa7.33□□□□□ -1.24
NEB-215ENST00000489048 HAMPP81172 84 aa7.33□□□□□ -1.24
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NEB-215ENST00000489048 C4orf26Q17RF5 130 aa7.28□□□□□ -1.24
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NEB-215ENST00000489048 HTN3P15516 51 aa7.27□□□□□ -1.25
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NEB-215ENST00000489048 H3BNG1 76 aa7.26□□□□□ -1.25
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NEB-215ENST00000489048 C15orf56Q8N910 161 aa7.25□□□□□ -1.25
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NEB-215ENST00000489048 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.24□□□□□ -1.25
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NEB-215ENST00000489048 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEB-215ENST00000489048 IGKV4-1P06312 121 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEB-215ENST00000489048 MTORP42345 2549 aa7.21□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.21□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 ACANP16112 2415 aa7.2□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 Q6ZRP5 223 aa7.2□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.2□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 MAST4O15021 2626 aa7.2□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GW54 56 aa7.19□□□□□ -1.26
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