RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487841.5

SFT2D1-204, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SFT2D1, Length 2,576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-204ENST00000487841 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.62□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.61□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.61□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 H0YGX0 51 aa8.6□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 CXCL5P42830 114 aa8.6□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 ESRGQ1W209 222 aa8.6□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 COX17Q14061 63 aa8.6□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.59□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 C6orf99Q4VX62 202 aa8.59□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SFT2D1-204ENST00000487841 LYSTQ99698 3801 aa8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 TMEM126AQ9H061 195 aa8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.58□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.57□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 MRAPQ8TCY5 172 aa8.57□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 NDUFC2O95298 119 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 Q8N814 137 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.54□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.54□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 COL7A1Q02388 2944 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.52□□□□□ -1.04
SFT2D1-204ENST00000487841 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 Q6ZRU5 148 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 ACYP1P07311 99 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 C15orf56Q8N910 161 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 TENM2Q9NT68 2774 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 H3BNG1 76 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC00846Q9NV44 126 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.48□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.48□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.48□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 IGLV6-57P01721 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC00575Q6W349 94 aa8.47□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.47□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC00643Q86TS7 51 aa8.47□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
SFT2D1-204ENST00000487841 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.46□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 hADV29S1A0JD25 119 aa8.46□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 Q6ZRP5 223 aa8.46□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.45□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 Q6ZQY7 126 aa8.45□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC00167Q96N53 147 aa8.45□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.45□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 CASC10Q5T4H9 136 aa8.45□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.44□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.43□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.43□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 VPREB1P12018 145 aa8.43□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 IMUPQ9GZP8 106 aa8.43□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 K7EIL1 84 aa8.42□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.42□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 A0A087WVE0 104 aa8.42□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 A0A1B0GX51 115 aa8.41□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 M0R2N4 97 aa8.41□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 DIRC1Q969H9 104 aa8.41□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 CCKP06307 115 aa8.4□□□□□ -1.06
SFT2D1-204ENST00000487841 SYCNQ0VAF6 134 aa8.4□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.4□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 MUC7Q8TAX7 377 aa8.4□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.39□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.39□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.38□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.38□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.38□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.38□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.37□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 FAM168BA1KXE4 195 aa8.37□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 C2orf48Q96LS8 159 aa8.37□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.36□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 COX7BP24311 80 aa8.36□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.36□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.36□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 UQCRQO14949 82 aa8.36□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 USP17L23D6RBM5 183 aa8.35□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 M0R378 163 aa8.35□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.35□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 Q6ZQT0 140 aa8.34□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.34□□□□□ -1.07
SFT2D1-204ENST00000487841 COX7CP15954 63 aa8.32□□□□□ -1.08
SFT2D1-204ENST00000487841 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms