RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 COX8AP10176 69 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 CXCL5P42830 114 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 PTTG1IPP53801 180 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-8P60410 259 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 GAGE2BQ13066 116 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 C14orf144Q96I85 54 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 ZNF815PA8K554 130 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 CKS1BP61024 79 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 F8WDY8 70 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZRP5 223 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 PRO1933Q9H354 126 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 DLEU1O43261 78 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YXY3 114 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 HERV-K104P63124 156 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 SFTA2Q6UW10 78 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 REG3GQ6UW15 175 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 ERG28Q9UKR5 140 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 RNF151Q2KHN1 245 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 LITAFQ99732 161 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 A0A0U1RRA0 63 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 TIMM17BO60830 172 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 SMIM13P0DJ93 91 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 PFN2P35080 140 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 RNF213Q63HN8 5207 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-212ENST00000485532 FAM168BA1KXE4 195 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 TSTD3H0UI37 97 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 LINC00158P58513 81 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 C1orf137Q5JT78 98 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 DAND5Q8N907 189 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 HIGD1BQ9P298 99 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 LINC00587B1AMM8 73 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 COX17Q14061 63 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 TMEM238C9JI98 176 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 SPANXCQ9NY87 97 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 GAGE2EQ4V326 116 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 LPAP08519 4548 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 IGLV7-43P04211 117 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 NPC2P61916 151 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 DDTP30046 118 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZVH6 145 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H4GQ99525 98 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-212ENST00000485532 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 IFITM1P13164 125 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 HSD52Q0P140 79 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 TAL2Q16559 108 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 CTAG1AP78358 180 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 Q8NDZ9 215 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 DIRC1Q969H9 104 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 H0Y9J4 135 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 M0QXV9 152 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 CEND1Q8N111 149 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 FXYD2P54710 66 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 COPS9Q8WXC6 57 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 A4D1N5 150 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 VPREB1P12018 145 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 UBE2BP63146 152 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-212ENST00000485532 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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