RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414		Q5VSD8	79 aa		15.23	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	PCP2	Q8IVA1	136 aa		15.23	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414		M0QXV9	152 aa		15.22	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	TIMM17B	O60830	172 aa		15.22	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		15.22	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	C22orf24	Q9Y442	160 aa		15.22	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		15.21	■□□□□ 0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		15.19	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		15.19	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	DAND5	Q8N907	189 aa		15.19	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	LITAF	Q99732	161 aa		15.18	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	VPREB1	P12018	145 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	PYY3	Q5JQD4	70 aa		15.17	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		15.16	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		15.15	■□□□□ 0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		15.14	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414		Q8NDZ9	215 aa		15.14	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	VAMP8	Q9BV40	100 aa		15.14	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		15.14	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	UBE2B	P63146	152 aa		15.12	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		15.12	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		15.12	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM238	C9JI98	176 aa		15.11	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00167	Q96N53	147 aa		15.11	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	COX8A	P10176	69 aa		15.1	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SPATA45	Q537H7	98 aa		15.1	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		15.1	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		15.09	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		15.09	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SPANXC	Q9NY87	97 aa		15.09	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		15.09	■□□□□ 0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		15.08	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	DLEU1	O43261	78 aa		15.07	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414		Q6ZVH6	145 aa		15.07	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	GAGE10	A6NGK3	116 aa		15.06	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414		M0R378	163 aa		15.06	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	NDUFC2	O95298	119 aa		15.06	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	NPC2	P61916	151 aa		15.06	■□□□□ 0
KCNS3-205	ENST00000481414	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		15.04	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	IFITM1	P13164	125 aa		15.03	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	COPS9	Q8WXC6	57 aa		15.03	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	C14orf144	Q96I85	54 aa		15.03	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		15.03	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		15.02	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		15.02	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	C1orf137	Q5JT78	98 aa		15.02	■□□□□ -0
KCNS3-205	ENST00000481414	NCR3	O14931	201 aa		15.01	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		14.99	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	IGKV2D-28	P01615	120 aa		14.99	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		14.99	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		14.97	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	14.97	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		14.96	□□□□□ -0.01
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV7-43	P04211	117 aa		14.95	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	S100A12	P80511	92 aa		14.95	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		14.95	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	HIGD1B	Q9P298	99 aa		14.94	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		14.93	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		14.93	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	BCE1	O60756	84 aa		14.93	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	REG3G	Q6UW15	175 aa		14.92	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		14.92	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		14.92	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	DDT	P30046	118 aa		14.91	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		14.91	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM126A	Q9H061	195 aa		14.91	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV6-57	P01721	117 aa		14.9	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	SMIM6	P0DI80	62 aa		14.9	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		14.9	□□□□□ -0.02
KCNS3-205	ENST00000481414	PRY	O14603	147 aa		14.89	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		14.89	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	HIST1H4G	Q99525	98 aa		14.88	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		14.87	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF861P	O60384	105 aa		14.86	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	SPRR1A	P35321	89 aa		14.85	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		14.85	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		14.83	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		14.83	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		14.83	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		14.83	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414	DIRC1	Q969H9	104 aa		14.82	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414		A4D1N5	150 aa		14.81	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414	UBE2A	P49459	152 aa		14.81	□□□□□ -0.04
KCNS3-205	ENST00000481414	TAL2	Q16559	108 aa		14.81	□□□□□ -0.04

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