RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466996.5

LNP1-202, Transcript of leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

TSL 5

Gene LNP1, Length 1,723 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1-202ENST00000466996 TGP01266 2768 aa6.8□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 NDUFC2O95298 119 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 MIFP14174 115 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 COX17Q14061 63 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 LINC00167Q96N53 147 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 HTN3P15516 51 aa6.79□□□□□ -1.32
LNP1-202ENST00000466996 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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LNP1-202ENST00000466996 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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LNP1-202ENST00000466996 SPAG11BQ08648 103 aa6.77□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 Q8NDZ9 215 aa6.77□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 TENM3Q9P273 2699 aa6.76□□□□□ -1.33
LNP1-202ENST00000466996 C6orf223Q8N319 242 aa6.76□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 C10orf25Q5T742 122 aa6.75□□□□□ -1.33
LNP1-202ENST00000466996 Q8N814 137 aa6.75□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 Q6JHZ5 121 aa6.74□□□□□ -1.33
LNP1-202ENST00000466996 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.74□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 PRR34Q9NV39 138 aa6.73□□□□□ -1.33
LNP1-202ENST00000466996 LINC00846Q9NV44 126 aa6.73□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 C6orf99Q4VX62 202 aa6.73□□□□□ -1.33
LNP1-202ENST00000466996 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.73□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 ENHOQ6UWT2 76 aa6.72□□□□□ -1.33
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LNP1-202ENST00000466996 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.71□□□□□ -1.34
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LNP1-202ENST00000466996 CCKP06307 115 aa6.71□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.7□□□□□ -1.34
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LNP1-202ENST00000466996 LINC00575Q6W349 94 aa6.7□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.7□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 RETNQ9HD89 108 aa6.7□□□□□ -1.34
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LNP1-202ENST00000466996 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.69□□□□□ -1.34
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LNP1-202ENST00000466996 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.66□□□□□ -1.34
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LNP1-202ENST00000466996 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.65□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 C2orf48Q96LS8 159 aa6.65□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.65□□□□□ -1.34
LNP1-202ENST00000466996 H3BNG1 76 aa6.64□□□□□ -1.35
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LNP1-202ENST00000466996 DIRC1Q969H9 104 aa6.64□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.64□□□□□ -1.35
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LNP1-202ENST00000466996 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.63□□□□□ -1.35
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LNP1-202ENST00000466996 VPREB1P12018 145 aa6.62□□□□□ -1.35
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LNP1-202ENST00000466996 Q6ZQY7 126 aa6.62□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 C15orf56Q8N910 161 aa6.62□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.62□□□□□ -1.35
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LNP1-202ENST00000466996 H3BQ85 93 aa6.6□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 ESRGQ1W209 222 aa6.6□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 UBL5Q9BZL1 73 aa6.6□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 M0R2N4 97 aa6.59□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 CRYGAP11844 174 aa6.59□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.59□□□□□ -1.35
LNP1-202ENST00000466996 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.59□□□□□ -1.36
LNP1-202ENST00000466996 M0R378 163 aa6.59□□□□□ -1.36
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